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当患者出现腹痛、腹泻（水样便、脓血便），或伴有发热；粪便常规镜检异常，建议采集粪便标本，进行细菌培养。
2.标本采集与要求
标本的采集尽可能在应用抗菌药物治疗前，标本应收集在宽口便盒内，并加盖密封。如考虑空肠弯曲菌需要无血弯曲菌琼脂培养基。艰难梭状杆菌需在厌氧环境中生存，建议在床旁进行标本的采集及接种。接种后的标本立即放入厌氧袋内，送至实验室。重复采集标本，可提高阳性检出率。
（1）自然排便法
患者在干燥清洁便盆（避免使用坐式或蹲式马桶）内自然排便后， ，
挑取有脓血、黏液部分的粪便2-3g（液体粪便则取絮状物1-3ml）放入无菌便盒内送检。
若无黏液、脓血，则在粪便上多点采集送检。
（2）直肠拭子法（排便困难的患者或婴幼儿）
用肥皂水将肛门周围洗净，将沾有无菌生理盐水的棉拭子插入肛门4-5cm（儿童为2-3cm）。
棉拭子与直肠粘膜表面接触，轻轻旋转拭子，可明显在拭子上见到粪便。将带有粪便标本的棉拭子插入运送培养基，立即送检。
3.标签及申请单
申请单上应包括患者姓名、病历号、采集日期时间、诊断、相关旅行史等。标本标识要求有唯一标识号或条码。标本上的标签中应包括患者姓名、病历号、采集时间等。送检的新鲜标本应报告粪便的性状，标本表面或标本里面存在血液也应注明。
4.标本运输
（1）粪便标本应尽快送检，室温下运送标本时间不超过2小时。
（2）不能及时送检，可加入pH7.0磷酸盐甘油缓冲保存液或使用Cary-Blair运送培养基置于4℃冰箱保存，保存时间不超过24小时。
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